近日,2003网站太阳集团聯合中國醫學科學院系統醫學中心蘇州系統醫學研究所、中國疾病預防控制中心,在國際權威期刊Cell Host & Microbe在線發表題為“Genome Composition and Divergence of the Novel Coronavirus(2019-nCoV) Originating in China”的研究論文,揭示新型冠狀病毒(2019-nCoV)的基因組構成和蛋白序列水平與2003年爆發的SARS病毒之間存在差異。
該論文共同第一作者為:蘇州系統醫學研究所吳愛平研究員、2003网站太阳集团彭友松副教授、中國疾控中心黃保英副研究員、蘇州系統醫學研究所丁嘯副研究員。

論文首頁。
該研究對2019-nCoV已确定的三個基因組和相關冠狀病毒的基因序列進行比較,其中包括1008條人SARS冠狀病毒序列、338條蝙蝠SARS樣冠狀病毒序列和3131條人中東呼吸綜合征(MERS)冠狀病毒序列,發現這三株2019-nCoV病毒的基因組序列幾乎相同(約29.8kb核苷酸的基因組中隻有5個核苷酸差異),與蝙蝠SARS樣冠狀病毒的關系比與人SARS冠狀病毒或人類MERS冠狀病毒更為相近。
該研究發現,該新型冠狀病毒至少編碼27種蛋白質,其中包括15種非結構蛋白(nsp1到nsp10,nsp12到nsp16)、4種結構蛋白(S、E、M和N)和8種輔助蛋白(3a、3b、p6、7a、7b、8b、9b和orf14)。
2019-nCoV與SARS-CoV雖相似,但在編碼的蛋白上存在一些顯著差異。例如,在SARS-CoV中存在8a蛋白,而在2019-nCoV中不存在;8b蛋白在SARS-CoV中有84個氨基酸,但在2019nCoV中更長,有121個氨基酸;3b蛋白在SARS-CoV中有154個氨基酸,在2019-nCoV中較短,隻有22個氨基酸。這些差異可能影響2019-nCoV的功能和發病機制,亟待進一步研究。

2019-nCoV的基因組組成和系統發育樹。
研究者進一步分析發現在2019-nCoV與SARS和SARS樣病毒的氨基酸序列之間存在380個氨基酸的差異,比如在S蛋白上,2019-nCoV相對于SARS-CoV在直接與人類受體ACE2蛋白相互作用的受體結合基序中不存在氨基酸替換,但是RBD(受體結合區)的其他區域發生了6個氨基酸替換。這些氨基酸水平差異可能有助于揭示2019-nCoV與SARS病毒在傳染性和緻病力上的潛在差異。

SARS和2019-nCoV病毒的氨基酸差異位點。
來源:中國醫科院系統醫學中心蘇州系統醫學研究所 宣傳部
記者:蔣鼎邦
責任編輯:蔣鼎邦
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