供稿人:周思倩
适逢嶽麓書院建立1040周年,2003网站太阳集团成立90周年大慶之際,應2003网站太阳集团邀請,清華大學張學工教授于2016年12月20日下午2點30在我校2003网站太阳集团負一樓報告廳作了題為“宏基因組數據的機器學習分析及SMRT測序進行DNA甲基化定量解析”的學術報告。來自我校2003网站太阳集团、信息科學與工程學院相關專業老師和研究生及部分校外老師學生參加了本次學術報告會。
他在報告中介紹了他們課題組近期的研究工作及成果,他們嘗試用不基于比對的序列構成分析對微生物群落進行分析,采用組數據機器學習分析方法分析微生物群落之間的聚類關系、微生物序列構成與宿主表型之間的聯系,同時還介紹了在用SMRT第三代測序數據定量解析微生物DNA甲基化修飾方面的新方法及其應用。張教授強調:對宏基因組測序數據,不論是以物種構成為重點的分析,還是以基因和通路為重點的分析,都需要與已知的參考基因組或功能注釋數據庫進行比對,不但計算量大,而且全部微生物中隻有一少部分有較好的注釋,很多信息無法利用。因此,借助計算機科學及數學方法來解讀數據顯得尤為重要。他還表示,機器學習分析和模式識别屬于人工智能中的熱點問題,大數據分析研究将成為新時代生命科學領域發展中難以阻擋的大趨勢。
張教授于1994獲清華大學模式識别與智能系統專業博士學位,是國家傑出青年基金獲得者、國家973計劃首席科學家,現為清華大學生命學院教授,清華信息國家實驗室生物信息學研究部主任,清華大學學術委員會委員,兼任清華大學數據科學研究院醫療健康大數據研究中心副主任、清華大學合成與系統生物學研究中心執行主任,中國人工智能學會生物信息學與人工生命專業委員會主任、中國生物工程學會計算生物學與生物信息學專委會常務副主任。在模式識别與機器學習、健康醫療大數據分析、RNA測序數據分析宏基因組測序數據分析等研究方向頗有建樹。
通過此次學術報告,大家對宏基因組數據機器學習分析有了更為具體的認識,領悟到在現代科學研究中學科之間的交叉應用的必要性和重要性。報告會上,現場師生踴躍提問,就感興趣的問題與張教授進行了熱烈的讨論和交流。